O 抗原ポリマーがリピド A のコアと結合すると、重合反応が停止します。つまり、結合反応により重合反応を停止させることができる。リピド A のコアと、異なる長さの繰り返し単位を持つリポ多糖の両方を効果的に外膜に移動させることができます。したがって、リポ多糖の分子サイズは、出力システムの要因ではなく、生合成システムの違いによって引き起こされるSDS-PAGEによって見ることができます。

細菌ごとに O 抗原の側鎖の分布は異なり、約 20 の反復単位を含むものもあれば、約 100 の反復単位を含むものもある。 SDS-PAGE 電気泳動では、さまざまな種類の細菌のさまざまな分子の銀染色強度の違いが反映されます。細菌ごとに O 抗原の側鎖長の分布が異なる理由は、O 抗原の重縮合や結合反応の過程にサイズ選択因子があるためと考えられます。 Wzz (Rol または Cld) は、Wzy 依存経路を介して抗原を合成する細菌の側鎖長の分布を制御する重要なタンパク質ですが、その具体的なメカニズムはまだ不明です。